Фоновое изображение нейронов
Логотип OptoNeuron OptoNeuron

Визуализация нейронной активности

Растровая диаграмма

Отображает временную динамику спайковой активности нейронов.

Тепловая карта

Отображает временную динамику спайковой активности нейронов. Цвет отражает порядок активации (от фиолетового - ранние, до желтого - поздние).

О программе MILF (Multispike Interval Loader and Finder)

Функциональные возможности программы включают:


    1. Загрузку и обработку данных

  • Чтение данных в формате HDF5 (*.h5), содержащих результаты работы нейронной сети.
  • Предварительная фильтрация и нормализация сигналов.

    • 2. Детекцию нейронных спайков

  • Автоматическое обнаружение спайковых событий на основе статистического критерия (порог детекции: >4σ относительно стандартного отклонения фоновой активности).

    • 3. Идентификацию бёрстов (пачек спайков)

  • Алгоритмическое выделение бёрст-активности с учетом пользовательских параметров (минимальная длительность, интервал между спайками, пороговая частота и др.).
  • Верификация результатов с применением алгоритма кластеризации DBSCAN (Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise) для исключения артефактов и шумов.

    • 4. Визуализацию и статистический анализ

  • Генерация графического представления исходных данных, спайков и бёрстов.
  • Расчет статистических параметров бёрст-активности (частота возникновения, длительность, количество спайков в бёрсте и др.).